Nov 25, 2016 06:37
7 yrs ago
2 viewers *
English term

Reed\'s Reference fit

English to Russian Science Biology (-tech,-chem,micro-) КД спектры белков в области дальнего УФ
Прошу помощи с переводом фразы:
The obtained far UV CD spectrum was also deconvoluted by Reed's Reference fit to estimate the secondary elements.
Из данных И-нета (к сожалению, только англоязычных) понял, что существует база эталонных спектров Рида, позволяющая определять вторичную структуру белков. Пока механически перевёл:
"Для анализа элементов вторичных структур полученные в дальнем УФ-диапазоне спектры КД были также деконволюированы с помощью эталонных спектров Рида."
Прошу у коллег самого краткого ликбеза по Reed's Reference и (если надо) коррекции перевода.
Заранее спасибо.

Proposed translations

2 hrs
Selected

см.

Не моя область, но предложил бы перевести так:
Разложение на компоненты/деконволюцию полученных УФ спектров КД для оценки вклада различных форм вторичной структуры проводили с использованием эталонных спектров Рида/метода эталонных спектров

см. напр.:
Метод "эталонных спектров" [2,3]. Методы предсказания вторичной структуры белков по их спектрам КД основаны на предположении о том, что спектры КД различных структурных форм, составляющих белковую молекулу, дают аддитивный вклад в спектр КД белка в целом.
http://bibliofond.ru/view.aspx?id=479316#_Toc281031693

--------------------------------------------------
Note added at 6 hrs (2016-11-25 13:24:54 GMT)
--------------------------------------------------

да, на мой взгляд, конволюция здесь - это именно разложение спектра анализируемого образца на составляющие, соответствующие эталонным спектрам

из того же учебника ниже
Эталонные спектры для всех структурных форм могут быть вычислены на основании набора базисных спектров КД (спектров белков с известной вторичной структурой - коэффициентами ) с помощью метода наименьших квадратов и формулы (1.2.1), примененной к каждому базисному спектру. После этого экспериментальный спектр КД исследуемого белка с помощью того же метода наименьших квадратов может быть аппроксимирован по формуле (1.2.1) с использованием вычисленных эталонных спектров. При этом вклад каждого из эталонных спектров будет равен доле соответствующей ему структурной форме в общей структуре белка

то же самое написано у Елизаветы в первом ответе, но на английском
Reed’s reference spectra are extracted from the CD spectra of peptides, and are suited to the secondary structure analysis of peptides; because of lesser effects on CD caused by
the side chains of aromatic amino acids often found in proteins.

--------------------------------------------------
Note added at 1 day6 hrs (2016-11-26 12:48:47 GMT)
--------------------------------------------------

из свежих вопросов:
http://www.proz.com/kudoz/english_to_russian/medical_pharmac...
Note from asker:
Игорь, спасибо за инф-ю. Я правильно понимаю, что получив деконволюированный КД-УФ спектр, аналитик сравнивает его с набором эталонных спектров, соответствующих определённым структурам белка, и, таким образом, выбирает эталонную структуру, наиболее близкую к его спектру?
Деконволюция здесь - это разложение реального спектра белка на спектры составляющих его структурных форм?
Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer.
1 hr

эталонные спектры Рида/Инфракрасные спектры поглощения белка для анализа вторичной структуры

Definition - Plos - Public Library of Science
journals.plos.org/plosone/article/asset?id=10.1371/journal.pone...
Previous studies also showed that the kinesin-II motor subunits associate .... Far-UV circular dichroism (CD) analysis, which is the appropriate secondary ... A deconvolution analysis of the CD spectrum, using the Reed method [40] ... The enthalpy change at the midpoint of transition, obtained by nonlinear least square fit of ...

Reed J, Reed TA (1997) A set of constructed type spectra for the practical
estimation of peptide secondary structure from circular dichroism. Anal
Biochem 254: 36–40.
http://www.oalib.com/references/7435863

Descărcare
www.jasco.ro/?download_file_id=4669&file...E...
NMR and X-ray crystal structure analysis are both very effective methods in the ... By comparison, analysis using circular dichroism is very straightforward and can be ... The JWSSE-513 protein secondary structure analysis program
uses a Classical Least Squares (CLS) method, which includes the reference spectra of Yang1) and Reed2). Yang’s reference spectra are extracted from CD spectra of proteins, and are best suited to protein secondary structure analysis1), 3). Reed’s reference spectra are extracted from the CD spectra of peptides, and are suited to the secondary structure analysis of peptides; because of lesser effects on CD caused by
the side chains of aromatic amino acids often found in proteins. For the secondary structure estimation of peptides, the JWSSE-513 protein secondary structure analysis program using Reed’s reference spectra is extremely effective. The data shown here is an example of CD spectral change in poly-L-glutamic acid sodium solution with titration with dilute sulfuric acid. The changes in secondary structure are reported
below.
,.

Инфракрасная спектроскопия и спектроскопия кругового ...
bibliofond.ru/view.aspx?id=479316
Методы определения вторичной структуры белков'. ... структуры белка основаны на изучении спектров именно пептидных ... Инфракрасные спектры поглощения белка также пригодны для анализа его вторичной структуры [1]. .... где и - эталонные спектры для a-спирали из n аминокислотных остатков и ...

Р 4.2.2643-10 Методы лабораторных ... - Разработка ТУ
russcert.ru/.../METODY_LABORATORNYH_ISSLEDOVANIJ_I_ISPYTA...
спектр поглощения в области 190-400 нм; 2) время удерживания в заданных условиях ...... Отсчет времени воздействия эталонного раствора начинают с момента смачивания ...... Инфекционные титры вычисляют по методу Рида и ... (Reed L.J., Muench H.A. A simple method of estimating 50% endpoints.

--------------------------------------------------
Note added at 1 hr (2016-11-25 08:04:01 GMT)
--------------------------------------------------

https://xpir.ru/dossier/project/corebofs000080000jhckl1i623s...
Инфракрасная спектроскопия и спектроскопия кругового ...
referat-web.com/Инфракрасная-спектроскопия-и-спект...
Спектры кругового дихроизма белков1.1 Явление кругового дихроизма .... где и - эталонные спектры для a-спирали из аминокислотных остатков и для ...

--------------------------------------------------
Note added at 1 hr (2016-11-25 08:15:34 GMT)
--------------------------------------------------

http://millit.ru/referaty-po-medicine/uchebnoe-posobie-infra...
Something went wrong...
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search